Le gestionnaire de paie exerce son activité au sein d’organisations relevant des secteurs privé ou public, marchand ou non marchand. Dans les moyennes et grandes entreprises, il est rattaché, selon l’organisation du travail, soit à la direction comptable et financière, soit à la direction des ressources humaines, le plus souvent au sein d’un service dédié, communément appelé « pôle social ». Au sein d’un cabinet d’expertise comptable, le gestionnaire de paie est généralement intégré à une cellule paie ou à une entité spécialisée. Lorsqu’il exerce auprès d’un prestataire en paie, il assure le traitement de la paie pour le compte d’entreprises clientes ou de cabinets d’expertise comptable.